MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 8038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013665	ATC	2	6	2	7	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013665	A	6	6	65	70	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013665	A	6	6	78	83	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013665	A	6	6	86	91	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013665	A	6	6	95	100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013665	AT	3	6	139	144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013665	AC	3	6	146	151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013665	AGTT	2	8	171	178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013665	ACA	2	6	205	210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013665	ATG	2	6	272	277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013665	ATG	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013665	TCATT	2	10	507	516	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013665	ACAT	2	8	539	546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013665	CCG	2	6	569	574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013665	TCA	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013665	TCC	2	6	2299	2304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013665	C	6	6	2872	2877	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_013665	TTG	2	6	2925	2930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013665	AAG	2	6	2951	2956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013665	A	6	6	3998	4003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013665	G	6	6	5391	5396	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013665	TCGGCC	2	12	7265	7276	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013665	TCC	2	6	11478	11483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_013665	CA	3	6	11531	11536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013665	CG	3	6	11633	11638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013665	ATT	3	9	13289	13297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013665	TA	3	6	13316	13321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013665	A	6	6	13363	13368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013665	TAA	2	6	13762	13767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013665	GAA	2	6	13804	13809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013665	ATT	2	6	13839	13844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013665	ATG	2	6	13916	13921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013665	CTC	2	6	14856	14861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013665	GC	3	6	14872	14877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013665	AG	3	6	15673	15678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013665	T	6	6	16337	16342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013665	ACA	2	6	16344	16349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013665	TTA	2	6	16350	16355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013665	TA	3	6	16354	16359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013665	TA	3	6	16366	16371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013665	ATT	2	6	18914	18919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013665	TTC	2	6	20255	20260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013665	AAC	2	6	20712	20717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013665	TAT	2	6	20721	20726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013665	AT	4	8	24722	24729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013665	CTTT	2	8	24837	24844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013665	AAG	2	6	24846	24851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013665	TAA	3	9	24896	24904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013665	GCG	2	6	24943	24948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013665	CAT	2	6	24952	24957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013665	GAC	2	6	24958	24963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013665	TTC	2	6	24977	24982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013665	ATTAAT	2	12	25041	25052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013665	T	6	6	26994	26999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013665	AATA	2	8	27047	27054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013665	A	6	6	28311	28316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013665	GAC	2	6	28785	28790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013665	ACG	2	6	28798	28803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013665	GGC	2	6	28811	28816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013665	GCG	2	6	28824	28829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013665	ATT	2	6	28894	28899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013665	A	6	6	28902	28907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013665	AT	3	6	28914	28919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013665	T	6	6	28953	28958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013665	CGG	2	6	28960	28965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013665	GTA	3	9	29012	29020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013665	T	6	6	29036	29041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013665	TCC	3	9	30533	30541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_013665	CCGC	2	8	30567	30574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_013665	GGA	2	6	30580	30585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013665	GTC	2	6	30610	30615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013665	CGC	3	9	30622	30630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_013665	TCG	2	6	30638	30643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013665	GCC	2	6	30662	30667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013665	T	6	6	32356	32361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013665	TAT	3	9	32373	32381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013665	ATA	3	9	34227	34235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013665	TTA	2	6	34310	34315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013665	TA	4	8	36184	36191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013665	TCG	2	6	36221	36226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013665	AGG	2	6	36266	36271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013665	AGA	2	6	36284	36289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013665	T	6	6	37149	37154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013665	TA	4	8	37158	37165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013665	CCG	2	6	37174	37179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013665	T	7	7	37191	37197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013665	GCG	2	6	37278	37283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013665	A	6	6	37315	37320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013665	ACA	2	6	37346	37351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013665	ATC	2	6	38596	38601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013665	CCGG	2	8	38607	38614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013665	A	6	6	38621	38626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013665	GT	3	6	39066	39071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013665	T	6	6	39122	39127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013665	T	6	6	39138	39143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013665	GGGC	2	8	39153	39160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013665	ATG	2	6	39175	39180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013665	CAGG	2	8	39222	39229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013665	T	7	7	39231	39237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013665	AT	3	6	39239	39244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013665	TTC	2	6	39247	39252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013665	ATA	2	6	39255	39260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013665	TAT	2	6	39631	39636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013665	TAA	2	6	39652	39657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013665	AT	3	6	39714	39719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013665	GGT	2	6	39733	39738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013665	GTT	2	6	42200	42205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013665	AATTC	2	10	42212	42221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013665	ATT	2	6	42225	42230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013665	ACATT	2	10	42318	42327	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_013665	TCAA	2	8	42332	42339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013665	AT	3	6	42373	42378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013665	G	6	6	43445	43450	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013665	CATACG	2	12	45594	45605	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013665	TC	3	6	45636	45641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013665	TGT	2	6	45663	45668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013665	GAC	2	6	45694	45699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013665	AAGTA	2	10	45734	45743	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013665	TTACA	2	10	45901	45910	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013665	A	7	7	45934	45940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013665	ATA	2	6	46529	46534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013665	CTAA	2	8	46543	46550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013665	ATT	2	6	46624	46629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013665	T	7	7	47570	47576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013665	TAT	2	6	47620	47625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013665	AT	3	6	47647	47652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013665	TA	3	6	47660	47665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013665	GCC	2	6	49975	49980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_013665	G	6	6	51065	51070	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013665	CCT	2	6	51895	51900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_013665	G	6	6	51917	51922	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013665	ACA	2	6	51937	51942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013665	TTAA	2	8	51989	51996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013665	TA	3	6	52039	52044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013665	A	7	7	52147	52153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013665	ATA	2	6	52205	52210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013665	GCC	2	6	53761	53766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_013665	TCT	2	6	54431	54436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013665	AT	3	6	57599	57604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013665	TTC	2	6	57614	57619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013665	AATA	2	8	57635	57642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013665	AG	3	6	57647	57652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013665	T	7	7	57665	57671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013665	GAA	2	6	57743	57748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013665	GAA	2	6	57758	57763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013665	GCT	2	6	57765	57770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013665	GAA	3	9	57773	57781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013665	T	6	6	57801	57806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013665	TAT	2	6	57840	57845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013665	CTT	2	6	58459	58464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013665	TAT	2	6	59802	59807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013665	AT	3	6	59859	59864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_013665	GCC	2	6	107038	107043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
294	NC_013665	CGG	2	6	107054	107059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_013665	GTG	2	6	107065	107070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_013665	ACC	2	6	107934	107939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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421	NC_013665	A	7	7	139240	139246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_013665	AAT	2	6	143826	143831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_013665	T	7	7	143840	143846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_013665	CAC	2	6	143889	143894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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429	NC_013665	A	8	8	144104	144111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_013665	TCAG	2	8	144161	144168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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432	NC_013665	CT	3	6	146611	146616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
433	NC_013665	AT	3	6	146657	146662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_013665	T	6	6	146662	146667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_013665	CTA	2	6	146706	146711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_013665	TAT	2	6	150796	150801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_013665	A	6	6	152709	152714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_013665	A	7	7	159077	159083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_013665	TA	4	8	159103	159110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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